药物研究院为公司的下属机构。主要从事新产品（即化学药、中药、保健品）的研究开发；另外对公司现有产品的工艺改进、质量标准的提高以及技术资料、临床资料的收集、整理和完善。药物研究院下设产品开发部、中药室和化学药品室，其核心职能是为公司生产、营销提供技术支持，为公司的发展研发新产品、提供新项目。

　　药物研究院有研发人员25人，正高职称2人，副高职称3人，中级职称8人，初级职称12人。

　　药物研究院与国内科研机构建立并保持了良好的合作关系。与四川大学药学院和华西医学中心（原华西医科大学药学院和华西附一院）在天然药物化学研究、药理毒理研究、中药制剂研究、生物等效性研究、药物临床评价等方面进行合作；与中国医学科学院药物所在药物合成、药物新剂型等方面进行合作；与四川省人民医院、成都军区总医院在药物临床评价等方面进行合作。同时药物研究院希望在新产品研发方面与国内外更多的研究机构、制药企业进行广泛的合作。